La bouche montre, comme chez le gobie vert, des dents coniques voyantes, bien que son alimentation soit essentiellement constituée de plancton.

Comme le gobie vert, il est hermaphrodite : le sexe est défini avec l’âge et peut changer dans les deux sens, selon les circonstances.

Comme le gobie vert Gobiodon histrio il aime installer sa maison dans les branches coralliennes du genre Acropora et est protégé par un mucus toxique, amer au goût de prédateurs.

Comme le gobie vert, le gobie Okinawa n’a pas d’ennemis et il a un niveau de vulnérabilité très faible, de 10 sur une échelle de 100, avec des populations qui peuvent doubler en moins de 15 mois.